К концу строительства в 2011 году было принято окончательное решение исключить гостиничную часть из башни и заменить её на апартаменты. Таким образом, "Империя" стала сочетать офисы класса А (этажи 4–41) и жилые помещения (этажи 43–59), включая двухуровневые пентхаусы на верхних этажах. Общая площадь апартаментов составила 45 377 м².

К концу 2008 года велось бетонирование башни выше 50-го этажа, а также были возведены 2 этажа будущего аквапарка. Комплекс должны были закончить в 2009 году, но строительство затянулось из-за мирового финансового кризиса. К лету 2009 года объём инвестиций в проект составил 7,5 млрд рублей. Несмотря на кризис, работы продолжались, хотя и с меньшей интенсивностью.

Компания AFI Development впервые объявила о строительстве крупнейшего торгово-развлекательного комплекса на территории Москва-Сити: на тот момент проект носил название Mall of Russia. Девелопер рассчитывал открыть комплекс до конца 2009 года.AFI Development подтверждала намерение завершить строительство торгового центра в установленные сроки. Однако в течение следующих двух лет дата открытия комплекса постоянно переносилась.

В 1996 году началось строительство Башни 2000 и моста "Багратион". Проект курировала российская компания Mabetex по заказу фонда "Реформа" - отсюда изначальное название здания. Инвестиции в подготовку территории и строительство составили 100 млн долларов.